Tarafından
Çığır açan bir çalışmada, St. Jude Çocuk Araştırma Hastanesi’ndeki araştırmacılar, akut lenfoblastik löseminin (ALL) farklı genetik alt tiplerinin çeşitli ilaçlara nasıl tepki verdiğine dair şimdiye kadarki en kapsamlı verileri topladılar. Bu bilgiler, her bir hasta için tedaviyi özelleştirmek için bir yol haritası sunarak gerçekten kişiselleştirilmiş hassas tıbbın yolunu açar.
Jude Çocuk Araştırma Hastanesi’ndeki bilim adamları, akut lenfoblastik löseminin (ALL) farklı genetik alt tipleri arasında ilaç tepkisindeki varyasyonları açıklayan bugüne kadarki en kapsamlı çalışmayı bildiriyorlar. Bulgular, terapiyi daha da bireyselleştirmek için hassas tıp için bir plan sunuyor. Çalışma bugün (5 Ocak 2023) içinde yayınlanacak. Doğa Tıbbı.
ALL, bir lenfosit kanseri (bir tür beyaz kan hücresi), en yaygın çocukluk kanseridir. ALL’li çocukların yaklaşık %98’i tedaviye başladıktan sonraki haftalar içinde remisyona girer ve bu çocukların yaklaşık %90’ı sonunda iyileşir. ALL için modern tedavi riske uyarlanmıştır, yani kemoterapi klinik özelliklere, lösemi genomiklerine ve ilk tedaviden sonra kalan kanser hücrelerinin mikroskobik seviyelerinin varlığı olan minimal rezidüel hastalık (MRD) derecesine göre uyarlanmıştır.
Farmakogenomik, genetik özelliklerin ilaç yanıtını nasıl etkilediğinin incelenmesidir. St. Jude bilim adamları şimdi, kanser hücrelerinin kanser genomikleri bağlamında farklı terapötiklere nasıl tepki verdiğini inceleyerek ALL’nin farmakogenomiklerini kapsamlı bir şekilde incelediler. 800’den fazla hastadan alınan sonuçlar, ALL genelinde geniş değişkenliğin yanı sıra alt tipe göre farklı ilaç duyarlılığı modellerini ortaya çıkardı.
Wenjian Yang, Shawn Lee, MBBS ve Jun J. Yang, PhD, yakın zamanda çocukluk çağı lösemisinin farmakotiplemesine yönelik kapsamlı bir çalışma yayınladılar. Kredi: St. Jude Çocuk Araştırma Hastanesi
İlgili yazar Jun, “Geleneksel kanser genomik araştırmasıyla karşılaştırıldığında, farmakogenomik çalışmamız her hastanın ilaca yanıt fenotipini tanımlamakla başlar, ardından lösemi ilaç duyarlılığında hastalar arası değişkenliğin biyolojik temelini araştırmak için genomiklere bakarız” dedi. J. Yang, Ph.D., St. Jude Eczacılık ve Eczacılık Bilimleri Bölümüs. “Bu yaklaşım, klinisyenlerin hastaların tedaviye nasıl ve neden yanıt verdiğini daha iyi anlayarak bakımı değiştirmelerine yardımcı olabilecek spesifik genomik değişikliklerin terapötik etkilerine ışık tutuyor.”
Çalışmayı Yang ile birlikte yöneten emekli bir öğretim üyesi ve eski St. Jude başkanı ve CEO’su PharmD’den William Evans, “Bu çalışma, çocukluk çağı lösemisini tedavi etmek için kullanılan farklı ilaçların etkinliğine ilişkin zengin yeni bilgiler sağladı” dedi. . “Bu çalışma, St. Jude’da ve pediatrik kanser topluluğu genelinde onlarca yıllık ortak araştırmaların ürünüdür. St. Jude, bu kadar çok sayıda kanserli çocukta bu ölçekte keşifler üretmek için teknolojiler uygulayabilen tek yer olabilir.”
Araştırmacılar, en uygun prognoza sahip ALL alt tiplerinin, kemoterapötik ilaçlar olan asparaginaz ve glukokortikoidlere duyarlılıkla yakından bağlantılı olduğunu bulmuşlardır. Şaşırtıcı bir şekilde, bazı alt tipler genomiklerinde benzerdir ancak farklı ilaç duyarlılık modellerine sahiptir. Ekip ayrıca hastaların, bilinen risk faktörlerini hesaba kattıktan sonra bile prognozla ilişkili olan ilaca duyarlılık profillerine göre farklı gruplara ayrılabileceğini buldu. Bu, hayatta kalma sonuçları için bu grupları, TÜM farmakotipleri anlamanın önemini vurgulamaktadır.
İşlevsel bir bakış açısıyla TÜMÜ
Araştırmacılar, farklı St. Jude amiral gemisi Total Therapy ALL klinik deneylerini kapsayan yeni teşhis edilmiş ALL’li çocukları inceledi. Denemeler 20 yılı aşkın bir süreyi kapsıyor ve geniş ve benzersiz bir hasta verisi kohortu oluşturuyor. Bilim adamları, lösemi genomikleri tarafından tanımlanan 23 moleküler alt tipi temsil eden hastalarda lösemi hücrelerinin 18 farklı kemoterapi ilacına duyarlılığını belirlediler.
Bulgular, yüksek riskli veya olumlu alt türleri tanımlayan önceki çalışmalara işlevsel bir anlayış katıyor. Örneğin, ETV6-RUNX1 ALL olumlu bir prognoza sahipken, BCR-ABL1 benzeri ALL’nin prognozu kötüdür. Bu farmakogenomik bulgular, bu alt tiplere sahip bireylerin neden belirli prognoz tiplerine sahip olduğuna dair fikir verdi. Bu verilerin başka bir potansiyel uygulaması, yeni terapötik gelişimin önünü açabilecek, ilaç duyarlılığının altında yatan biyolojik yolları keşfetmektir. Örneğin, Yang laboratuvarı tarafından yapılan farmakogenomik çalışmaları daha önce, LCK aktivasyonunun T-ALL’deki ilaç dasatinib’e duyarlılığın altında yattığını ortaya çıkarmış, bu da onu bazı lösemilerde önemli bir hedef haline getirmiş ve konsepti test etmek için devam eden birkaç klinik çalışmanın geliştirilmesini teşvik etmiştir.
Bu çalışma için, araştırmacılar yüzbinlerce bireysel veri noktasını analiz ettiler. Çalışma böylece bilim camiası için önemli bir kaynak sağlamaktadır.
Eskiden St. Jude ve şimdi Khoo Teck Puat-National Üniversitesi’nden MBBS’den birinci yazar Shawn Lee, “Verilerimizin yakın gelecekte yeni nesil ALL denemelerini yürütmek için daha fazla keşfe ve yeni hedeflere yol açacağını umuyoruz” dedi. Çocuk Tıp Enstitüsü, Singapur Ulusal Üniversite Hastanesi.
Her yerdeki hastalar için önemli olan sonuçlar
Lee, “ALL aslında çok heterojen bir hastalıktır – genomik alt tipler arasında, sunum özellikleri ve prognoz gibi birçok farklılık vardır” dedi. “Şimdi, ilaç duyarlılığının da alt tipler arasında nasıl değiştiğini gösterdik.”
Araştırmacılar, ek popülasyon çeşitliliği ile bulguları genişletmek istiyor. Tüm dünyadaki pediatrik ALL farmakogenomiklerinin daha kapsamlı bir resmini yakalamaya yönelik bu tür çabalar, gelecekteki tedavilere biyolojik olarak bilinçli bir yaklaşım getirecektir.
“Bu çalışma, çocukları kanserlerine karşı işe yaramayacak ilaçların yan etkilerinden korumak ve kanserlerinin muhtemelen yanıt vereceği yeni tedavilere yönlendirmek için ALL tedavisini bireyselleştirmek için doğru yönde atılmış büyük bir adımdır.” Yang dedi. “Fonksiyonel hassas tıptır, sadece genetik ve hedeflerle ilgili değil, aynı zamanda doğru hastalar için doğru ilaçları kullanmakla da ilgilidir.”
Referans: 5 Ocak 2022, Doğa Tıbbı.
DOI: 10.1038/s41591-022-02112-7
Çalışmanın diğer yazarları, Sidney Kimmel Kapsamlı Kanser Merkezi’nden Gary Rosner; ve Wenjian Yang, Yoshihiro Gocho, August John, Lauren Rowland, Brandon Smart, Hannah Williams, Dylan Maxwell, Jeremy Hunt, Wentao Yang, Kristine Crews, Kathryn Roberts, Sima Jeha, Cheng Cheng, Seth Karol, Mary Relling, Hiroto Inaba, Charles Jude’dan Mullighan ve Ching-Hon Pui.
Çalışma Ulusal Sağlık Enstitüleri (GM115279, GM141947, CA26487, CA264610, CA021765), bir Singapur NMRC Araştırma Eğitim Bursu ve St.