Vücut kitle indeksi (BMI) ile hem bilinen hem de yeni gen ilişkilerinin tanımlanması, obezite biyolojisinin yanı sıra potansiyel biyobelirteçler ve tedavi hedefleri hakkında daha derin bir anlayış sunar.
Biyomedikal Bilişim Bölümü’nden araştırmacılar, çok ırklı bir kohorttan yararlanarak vücut kitle indeksi ile ilişkili gen ifadelerine ilişkin yeni bilgiler ortaya çıkardılar.
Colorado Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyomedikal Bilişim Bölümü (DBMI), çok ırklı bir kohort kullanan bir çalışma aracılığıyla vücut kitle indeksi (BMI) ile bağlantılı 45 geni ortaya çıkardı. Bu çalışma, obezite için potansiyel yeni biyobelirteçleri ortaya koymaktadır ve bu genlerin birçoğu daha önce obezite araştırmalarında çalışılmamıştır. Araştırma, 2000 yılında toplanan çeşitli ve kapsamlı bir kohorttan alınan verilerin analiz edilmesiyle yürütülmüştür.
Baş yazar Luciana Vargas, “Şimdiye kadar, atasal olarak farklı kohortlarda BMI ile ilgili birkaç genetik çalışma yapılmıştır” diye açıklıyor. “Çalışmamızın yeniliği, doğrudan ölçülen gen ekspresyonu verilerinin kullanılmasıdır.”
Vargas, CU Tıp Fakültesi Ph.D. kişiselleştirilmiş tıbba ilgi duyan bir öğrenci, bu bilinen ve yeni gen ilişkilerinin obezite biyolojisi, potansiyel biyobelirteçler ve terapötik hedefler hakkında bilgi sağlayabileceğini söylüyor.
Ethan Lange, Ph.D. ve Leslie Lange, Ph.D.’nin DBMI laboratuvarlarındaki araştırmacılar, çalışmaları için Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA) verilerini kullandılar. MESA piyasaya sürüldüğünde, risk faktörlerini ve kardiyovasküler hastalığın erken dönem özelliklerini araştırmak üzere ülke genelindeki altı saha merkezinden toplanan 6.000’den fazla kişiyi kaydettirdi. Katılımcılar, sağlık verilerinin toplanması için periyodik olarak saha merkezlerine bildirimde bulunmaya devam etmektedir. Büyük, etnik olarak çeşitli çalışma popülasyonu ve toplanan sağlık bilgisi miktarı nedeniyle, araştırmacılar verilerini çok sayıda çalışma için kullandılar. 2014 yılında başlatılan Ulusal Kalp, Akciğer ve Kan Enstitüsü tarafından finanse edilen Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) konsorsiyumu, MESA katılımcılarının bir alt kümesinin yanı sıra diğer pek çok katılımcıdan gen ekspresyonu ve diğer omik verilerini toplamaya başladı. kohortlar.
Omics, genler, metabolitler, proteinler gibi biyolojik moleküllerdeki ölçülebilir farklılıkları veya değişiklikleri ifade eder.[{” attribute=””>RNA.
“We used the MESA cohort because it’s really difficult to find a well-defined cohort with a lot of good clinical measurements, get the funding, and maintain the contact with study participants to collect blood and do these studies over time,” says Iain Konigsberg, Ph.D., a biomedical informatics research instructor who works with Vargas in the DBMI Lange Lab.
The researchers analyzed RNA sequencing data from four self-identified race and ethnic groups in the MESA cohort – African American, Chinese American, Hispanic, and White – to assess the association of expression of each gene for an effect on BMI. Many of the characteristics related to cardiovascular risk are also relevant to obesity, making the MESA cohort ideal for obesity research.
The 45 genes they identified had expressions associated with BMI across all four groups. While a small number of these genes have been identified through genetic association studies, the CU authors reported many novel associations.
Konigsberg says their work points to the need for more diversity in obesity research and expects the results of this study to inform additional downstream studies. He expects to continue research using MESA and additional human cohorts. It’s been a valuable lesson in collaborative research for Vargas, who began her studies at CU Anschutz in Fall 2021 as a Ph.D. student in the Human Medical Genetics and Genomics Program. This is her first paper as a graduate student and member of the Leslie Lange Lab.
“Getting involved with the TOPMed consortium that had enrolled thousands of people across the U.S. opened up new opportunities for research,” she says. “I really appreciate the power of collaboration.”
Reference: “Gene expression associations with body mass index in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis” by Luciana B. Vargas, Leslie A. Lange, Kendra Ferrier, François Aguet, Kristin Ardlie, Stacey Gabriel, Namrata Gupta, Joshua D. Smith, Thomas W. Blackwell, Jingzhong Ding, Peter Durda, Russell P. Tracy, Yongmei Liu, Kent D. Taylor, W. Craig Johnson, Stephen S. Rich, Jerome I. Rotter, Ethan M. Lange and Iain R. Konigsberg, 3 December 2022, International Journal of Obesity.
DOI: 10.1038/s41366-022-01240-x